MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Blattella germanica) str. Bge plasmid pBge

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015679	TG	3	6	809	814	0 %	50 %	50 %	0 %	336478155
2	NC_015679	ATC	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336478155
3	NC_015679	T	6	6	897	902	0 %	100 %	0 %	0 %	336478155
4	NC_015679	A	8	8	903	910	100 %	0 %	0 %	0 %	336478155
5	NC_015679	GAAA	2	8	931	938	75 %	0 %	25 %	0 %	336478155
6	NC_015679	TTTA	2	8	954	961	25 %	75 %	0 %	0 %	336478155
7	NC_015679	TCA	2	6	1017	1022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336478155
8	NC_015679	GA	3	6	1073	1078	50 %	0 %	50 %	0 %	336478155
9	NC_015679	TAT	2	6	1085	1090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336478155
10	NC_015679	CTT	2	6	1109	1114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478155
11	NC_015679	TTG	2	6	1115	1120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336478155
12	NC_015679	ACA	2	6	1163	1168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336478155
13	NC_015679	A	6	6	1182	1187	100 %	0 %	0 %	0 %	336478155
14	NC_015679	TAAA	2	8	1191	1198	75 %	25 %	0 %	0 %	336478155
15	NC_015679	TCT	2	6	1203	1208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478156
16	NC_015679	AAT	2	6	1234	1239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336478156
17	NC_015679	TA	3	6	1250	1255	50 %	50 %	0 %	0 %	336478156
18	NC_015679	T	7	7	1299	1305	0 %	100 %	0 %	0 %	336478156
19	NC_015679	T	10	10	1395	1404	0 %	100 %	0 %	0 %	336478156
20	NC_015679	T	7	7	1421	1427	0 %	100 %	0 %	0 %	336478156
21	NC_015679	TCT	2	6	1455	1460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478156
22	NC_015679	T	6	6	1469	1474	0 %	100 %	0 %	0 %	336478156
23	NC_015679	ATTT	2	8	1528	1535	25 %	75 %	0 %	0 %	336478156
24	NC_015679	AAT	2	6	1553	1558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336478156
25	NC_015679	TTA	2	6	1569	1574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336478156
26	NC_015679	AGA	2	6	1587	1592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336478156
27	NC_015679	T	7	7	1622	1628	0 %	100 %	0 %	0 %	336478156
28	NC_015679	ATA	2	6	1632	1637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336478156
29	NC_015679	GTA	2	6	1653	1658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336478156
30	NC_015679	TCA	2	6	1666	1671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336478156
31	NC_015679	T	6	6	1673	1678	0 %	100 %	0 %	0 %	336478157
32	NC_015679	CTT	2	6	1704	1709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478157
33	NC_015679	AGA	2	6	1714	1719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336478157
34	NC_015679	TATT	2	8	1755	1762	25 %	75 %	0 %	0 %	336478157
35	NC_015679	T	6	6	1775	1780	0 %	100 %	0 %	0 %	336478157
36	NC_015679	TTTTA	2	10	1795	1804	20 %	80 %	0 %	0 %	336478157
37	NC_015679	T	6	6	1831	1836	0 %	100 %	0 %	0 %	336478157
38	NC_015679	TAA	2	6	1887	1892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336478157
39	NC_015679	TTC	2	6	1911	1916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478157
40	NC_015679	AAT	2	6	1968	1973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336478157
41	NC_015679	CAA	2	6	1990	1995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336478157
42	NC_015679	A	6	6	2009	2014	100 %	0 %	0 %	0 %	336478157
43	NC_015679	T	6	6	2125	2130	0 %	100 %	0 %	0 %	336478158
44	NC_015679	T	9	9	2154	2162	0 %	100 %	0 %	0 %	336478158
45	NC_015679	GAA	2	6	2183	2188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336478158
46	NC_015679	A	6	6	2187	2192	100 %	0 %	0 %	0 %	336478158
47	NC_015679	A	7	7	2245	2251	100 %	0 %	0 %	0 %	336478158
48	NC_015679	TGT	2	6	2258	2263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336478158
49	NC_015679	TA	3	6	2278	2283	50 %	50 %	0 %	0 %	336478158
50	NC_015679	CT	3	6	2344	2349	0 %	50 %	0 %	50 %	336478158
51	NC_015679	T	6	6	2381	2386	0 %	100 %	0 %	0 %	336478158
52	NC_015679	TCT	2	6	2390	2395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478158
53	NC_015679	T	6	6	2395	2400	0 %	100 %	0 %	0 %	336478158
54	NC_015679	TAG	2	6	2403	2408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336478158
55	NC_015679	T	6	6	2453	2458	0 %	100 %	0 %	0 %	336478158
56	NC_015679	TTC	2	6	2488	2493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478158
57	NC_015679	T	6	6	2501	2506	0 %	100 %	0 %	0 %	336478158
58	NC_015679	TCA	2	6	2519	2524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336478158
59	NC_015679	A	6	6	2583	2588	100 %	0 %	0 %	0 %	336478158
60	NC_015679	TGT	2	6	2594	2599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336478158
61	NC_015679	AGA	2	6	2650	2655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336478158
62	NC_015679	GCA	3	9	2675	2683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336478158
63	NC_015679	CT	3	6	2713	2718	0 %	50 %	0 %	50 %	336478158
64	NC_015679	ATTGT	2	10	2719	2728	20 %	60 %	20 %	0 %	336478158
65	NC_015679	TTG	2	6	2775	2780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336478158
66	NC_015679	TCT	2	6	2786	2791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336478158
67	NC_015679	A	6	6	2792	2797	100 %	0 %	0 %	0 %	336478158
68	NC_015679	ATC	2	6	2806	2811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336478158
69	NC_015679	TAAG	2	8	2830	2837	50 %	25 %	25 %	0 %	336478158
70	NC_015679	CAT	2	6	2884	2889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336478158
71	NC_015679	GAA	2	6	3005	3010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336478158
72	NC_015679	ATTT	2	8	3046	3053	25 %	75 %	0 %	0 %	336478158
73	NC_015679	TGT	2	6	3077	3082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336478158
74	NC_015679	AAT	2	6	3090	3095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336478158
75	NC_015679	T	7	7	3153	3159	0 %	100 %	0 %	0 %	336478158

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.